Skip to main content
OREGON STATE UNIVERSITY
Open search box
»
College of Agricultural Sciences
Toggle menu
Go to search page
Search Field
Exit Search
About
Employee Directory
Student Success Initiative
Research
Outreach and Extension
Agricultural Sciences and Natural Resources Extension Program
Faculty Resources
Extension Agriculture Peer Teaching Evaluation Forms
Outreach Programs
Units
Department and Program Leaders
Calendar
Library
Maps
Online Services
Make a Gift
About
Employee Directory
Student Success Initiative
Research
Outreach and Extension
Agricultural Sciences and Natural Resources Extension Program
Faculty Resources
Extension Agriculture Peer Teaching Evaluation Forms
Outreach Programs
Units
Department and Program Leaders
Biblio
Found 16 results
Author
[
Title
]
Type
Year
Filters:
Author
is
Elser, Justin
[Clear All Filters]
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
D
S. E. Fox
,
Geniza, M.
,
Hanumappa, M.
,
Naithani, S.
,
Sullivan, C. M.
,
Preece, J.
,
Tiwari, V. I. K.
,
Elser, J.
,
Leonard, J. M.
,
Sage, A.
,
Gresham, C.
,
Kerhornou, A.
,
Bolser, D.
,
McCarthy, F.
,
Kersey, P.
,
Lazo, G. R.
, and
Jaiswal, P.
,
“
De Novo Transcriptome Assembly and Analyses of Gene Expression during Photomorphogenesis in Diploid Wheat Triticum monococcum.
”
,
PLoS ONE
, vol. 9, 2014.
A. C Quandt
,
Di, Y.
,
Elser, J.
,
Jaiswal, P.
, and
Spatafora, J. W.
,
“
Differential Expression of Genes Involved in Host Recognition, Attachment, and Degradation in the Mycoparasite Tolypocladium ophioglossoides.
”
,
G3 (Bethesda, Md.)
, 2016.
A. C Quandt
,
Di, Y.
,
Elser, J.
,
Jaiswal, P.
, and
Spatafora, J. W.
,
“
Differential Expression of Genes Involved in Host Recognition, Attachment, and Degradation in the Mycoparasite Tolypocladium ophioglossoides.
”
,
G3 (Bethesda, Md.)
, vol. 6, pp. 731-41, 2016.
A. C Quandt
,
Di, Y.
,
Elser, J.
,
Jaiswal, P.
, and
Spatafora, J. W.
,
“
Differential Expression of Genes Involved in Host Recognition, Attachment, and Degradation in the Mycoparasite Tolypocladium ophioglossoides.
”
,
G3 (Bethesda, Md.)
, 2016.
G
A. A. Myburg
,
Grattapaglia, D.
,
Tuskan, G. A.
,
Hellsten, U.
,
Hayes, R. D.
,
Grimwood, J.
,
Jenkins, J.
,
Lindquist, E.
,
Tice, H.
,
Bauer, D.
,
Goodstein, D. M.
,
Dubchak, I.
,
Poliakov, A.
,
Mizrachi, E.
,
Kullan, A. R. K.
,
Hussey, S. G.
,
Pinard, D.
,
van der Merwe, K.
,
Singh, P.
,
van Jaarsveld, I.
,
Silva-Junior, O. B.
,
Togawa, R. C.
,
Pappas, M. R.
,
Faria, D. A.
,
Sansaloni, C. P.
,
Petroli, C. D.
,
Yang, X.
,
Ranjan, P.
,
Tschaplinski, T. J.
,
Ye, C. - Y.
,
Li, T.
,
Sterck, L.
,
Vanneste, K.
,
Murat, F.
,
Soler, çal
,
San Clemente, élène
,
Saidi, N.
,
Cassan-Wang, H.
,
Dunand, C.
,
Hefer, C. A.
,
Bornberg-Bauer, E.
,
Kersting, A. R.
,
Vining, K. J.
,
Amarasinghe, V.
,
Ranik, M.
,
Naithani, S.
,
Elser, J.
,
Boyd, A. E.
,
Liston, A.
,
Spatafora, J. W.
,
Dharmwardhana, P.
,
Raja, R.
,
Sullivan, C.
,
Romanel, E.
,
Alves-Ferreira, M.
,
ülheim, C.
,
Foley, W.
,
Carocha, V.
,
Paiva, J.
,
Kudrna, D.
,
Brommonschenkel, S. H.
,
Pasquali, G.
,
Byrne, M.
,
Rigault, P.
,
Tibbits, J.
,
Spokevicius, A.
,
Jones, R. C.
,
Steane, D. A.
,
Vaillancourt, éE.
,
Potts, B. M.
,
Joubert, F.
,
Barry, K.
,
Pappas, G. J.
,
Strauss, S. H.
,
Jaiswal, P.
,
Grima-Pettenati, J.
,
Salse, érôme
,
Van de Peer, Y.
,
Rokhsar, D. S.
, and
Schmutz, J.
,
“
The genome of Eucalyptus grandis
”
,
Nature
, vol. 51, no. 75, pp. 356 - 362, 2014.
A. A. Myburg
,
Grattapaglia, D.
,
Tuskan, G. A.
,
Hellsten, U.
,
Hayes, R. D.
,
Grimwood, J.
,
Jenkins, J.
,
Lindquist, E.
,
Tice, H.
,
Bauer, D.
,
Goodstein, D. M.
,
Dubchak, I.
,
Poliakov, A.
,
Mizrachi, E.
,
Kullan, A. R. K.
,
Hussey, S. G.
,
Pinard, D.
,
van der Merwe, K.
,
Singh, P.
,
van Jaarsveld, I.
,
Silva-Junior, O. B.
,
Togawa, R. C.
,
Pappas, M. R.
,
Faria, D. A.
,
Sansaloni, C. P.
,
Petroli, C. D.
,
Yang, X.
,
Ranjan, P.
,
Tschaplinski, T. J.
,
Ye, C. - Y.
,
Li, T.
,
Sterck, L.
,
Vanneste, K.
,
Murat, F.
,
Soler, M.
,
San Clemente, H.
,
Saidi, N.
,
Cassan-Wang, H.
,
Dunand, C.
,
Hefer, C. A.
,
Bornberg-Bauer, E.
,
Kersting, A. R.
,
Vining, K.
,
Amarasinghe, V.
,
Ranik, M.
,
Naithani, S.
,
Elser, J.
,
Boyd, A. E.
,
Liston, A.
,
Spatafora, J. W.
,
Dharmwardhana, P.
,
Raja, R.
,
Sullivan, C.
,
Romanel, E.
,
Alves-Ferreira, M.
,
Külheim, C.
,
Foley, W.
,
Carocha, V.
,
Paiva, J.
,
Kudrna, D.
,
Brommonschenkel, S. H.
,
Pasquali, G.
,
Byrne, M.
,
Rigault, P.
,
Tibbits, J.
,
Spokevicius, A.
,
Jones, R. C.
,
Steane, D. A.
,
Vaillancourt, R. E.
,
Potts, B. M.
,
Joubert, F.
,
Barry, K.
,
Pappas, G. J.
,
Strauss, S. H.
,
Jaiswal, P.
,
Grima-Pettenati, J.
,
Salse, J.
,
Van de Peer, Y.
,
Rokhsar, D. S.
, and
Schmutz, J.
,
“
The genome of Eucalyptus grandis.
”
,
Nature
, vol. 510, pp. 356-62, 2014.
K. E. Bushley
,
Raja, R.
,
Jaiswal, P.
,
Cumbie, J. S.
,
Nonogaki, M.
,
Boyd, A. E.
,
C Owensby, A.
,
Knaus, B. J.
,
Elser, J.
,
Miller, D.
,
Di, Y.
,
McPhail, K. L.
, and
Spatafora, J. W.
,
“
The Genome of Tolypocladium inflatum: Evolution, Organization, and Expression of the Cyclosporin Biosynthetic Gene Cluster
”
,
PLOS Genetics
, vol. 9, 2013.
V. Shulaev
,
Sargent, D. J.
,
Crowhurst, R. N.
,
Mockler, T. C.
,
Folkerts, O.
,
Delcher, A. L.
,
Jaiswal, P.
,
Mockaitis, K.
,
Liston, A.
,
Mane, S. P.
,
Burns, P.
,
Davis, T. M.
,
Slovin, J. P.
,
Bassil, N.
,
Hellens, R. P.
,
Evans, C.
,
Harkins, T.
,
Kodira, C.
,
Desany, B.
,
Crasta, O. R.
,
Jensen, R. V.
,
Allan, A. C.
,
Michael, T. P.
,
Setubal, J. Carlos
,
Celton, J. - M.
,
D Rees, J. G.
,
Williams, K. P.
,
Holt, S. H.
,
Rojas, J. Jairo Ruiz
,
Chatterjee, M.
,
Liu, B.
,
Silva, H.
,
Meisel, L.
,
Adato, A.
,
Filichkin, S. A.
,
Troggio, M.
,
Viola, R.
,
Ashman, T. - L.
,
Wang, H.
,
Dharmawardhana, P.
,
Elser, J.
,
Raja, R.
,
Priest, H. D.
,
Bryant, D. W.
,
Fox, S. E.
,
Givan, S. A.
,
Wilhelm, L. J.
,
Naithani, S.
,
Christoffels, A.
,
Salama, D. Y.
,
Carter, J.
,
Girona, E. Lopez
,
Zdepski, A.
,
Wang, W.
,
Kerstetter, R. A.
,
Schwab, W.
,
Korban, S. S.
,
Davik, J.
,
Monfort, A.
,
Denoyes-Rothan, B.
,
Arus, P.
,
Mittler, R.
,
Flinn, B.
,
Aharoni, A.
,
Bennetzen, J. L.
,
Salzberg, S. L.
,
Dickerman, A. W.
,
Velasco, R.
,
Borodovsky, M.
,
Veilleux, R. E.
, and
Folta, K. M.
,
“
The genome of woodland strawberry(Fragaria vesca).
”
,
Nature genetics
, vol. 43, pp. 109-16, 2011.
M. K. Tello-Ruiz
,
Stein, J.
,
Wei, S.
,
Preece, J.
,
Olson, A.
,
Naithani, S.
,
Amarasinghe, V.
,
Dharmawardhana, P.
,
Jiao, Y.
,
Mulvaney, J.
,
Kumari, S.
,
Chougule, K.
,
Elser, J.
,
Wang, B.
,
Thomason, J.
,
Bolser, D. M.
,
Kerhornou, A.
,
Walts, B.
,
Fonseca, N. A.
,
Huerta, L.
,
Keays, M.
,
Y Tang, A.
,
Parkinson, H.
,
Fabregat, A.
,
McKay, S.
,
Weiser, J.
,
D’Eustachio, P.
,
Stein, L.
,
Petryszak, R.
,
Kersey, P. J.
,
Jaiswal, P.
, and
Ware, D.
,
“
Gramene 2016: comparative plant genomics and pathway resources.
”
,
Nucleic acids research
, vol. 44, pp. D1133-40, 2016.
M. K. Tello-Ruiz
,
Naithani, S.
,
Stein, J. C.
,
Gupta, P.
,
Campbell, M.
,
Olson, A.
,
Wei, S.
,
Preece, J.
,
Geniza, M. J.
,
Jiao, Y.
,
Lee, Y. Koung
,
Wang, B.
,
Mulvaney, J.
,
Chougule, K.
,
Elser, J.
,
Al-Bader, N.
,
Kumari, S.
,
Thomason, J.
,
Kumar, V.
,
Bolser, D. M.
,
Naamati, G.
,
Tapanari, E.
,
Fonseca, N.
,
Huerta, L.
,
Iqbal, H.
,
Keays, M.
,
Fuentes, A. Munoz- Pome
,
Tang, A.
,
Fabregat, A.
,
D’Eustachio, P.
,
Weiser, J.
,
Stein, L. D.
,
Petryszak, R.
,
Papatheodorou, I.
,
Kersey, P. J.
,
Lockhart, P.
,
Taylor, C.
,
Jaiswal, P.
, and
Ware, D.
,
“
Gramene 2018: unifying comparative genomics and pathway resources for plant research.
”
,
Nucleic acids research
, vol. 46, pp. D1181-D1189, 2018.
I
B. Qu
,
Kumar, P.
,
Zhang, E.
,
Jaiswal, P.
,
Cooper, L.
,
Elser, J.
, and
Zhang, Y.
,
“
Interactive Design and Visualization of N-ary Relationships
”
, in
SIGGRAPH Asia 2017 Symposium on Visualization
, New York, NY, USA, 2017.
O
R. L. Walls
,
Athreya, B.
,
Cooper, L.
,
Elser, J.
,
Gandolfo, M. A.
,
Jaiswal, P.
,
Mungall, C. J.
,
Preece, J.
,
Rensing, S.
,
Smith, B.
, and
Stevenson, D. W.
,
“
Ontologies as integrative tools for plant science.
”
,
American journal of botany
, vol. 99, pp. 1-13, 2012.
P
L. Cooper
,
Walls, R. L.
,
Elser, J.
,
Gandolfo, M. A.
,
Stevenson, D. W.
,
Smith, B.
,
Preece, J.
,
Athreya, B.
,
Mungall, C. J.
,
Rensing, S.
,
Hiss, M.
,
Lang, D.
,
Reski, R.
,
Berardini, T. Z.
,
Li, D.
,
Huala, E.
,
Schaeffer, M.
,
Menda, N.
,
Arnaud, E.
,
Shrestha, R.
,
Yamazaki, Y.
, and
Jaiswal, P.
,
“
The Plant Ontology As A Tool For Comparative Plant Anatomy And Genomic Analyses.
”
,
Plant & Cell Physiology
, 2012.
R. L. Walls
,
Cooper, L.
,
Elser, J.
,
Gandolfo, M. Alejandra
,
Mungall, C. J.
,
Smith, B.
,
Stevenson, D. W.
, and
Jaiswal, P.
,
“
The Plant Ontology Facilitates Comparisons of Plant Development Stages Across Species.
”
,
Frontiers in plant science
, vol. 10, p. 631, 2019.
V
S. Naithani
,
Raja, R.
,
Waddell, E. N.
,
Elser, J.
,
Gouthu, S.
,
Deluc, L. G.
, and
Jaiswal, P.
,
“
VitisCyc: a metabolic pathway knowledgebase for grapevine (Vitis vinifera).
”
,
Frontiers in plant science
, vol. 5, p. 644, 2014.
W
M. Hanumappa
,
Preece, J.
,
Elser, J.
,
Nemeth, D.
,
Bono, G.
,
Wu, K.
, and
Jaiswal, P.
,
“
WikiPathways for plants: a community pathway curation portal and a case study in rice and arabidopsis seed development networks
”
,
Rice
, vol. 6, 2013.